除此之外，对于宁远大捷的处理，还有以下内容：
第一，俘虏调拨铁道司辖下，主要用于修筑通州到山海关的铁路。
第二，缴获的一万多匹战马，分一半到蓟州长城沿线，加强这边的防御力量。
第三，孔有德戴罪立功，归入东江镇吴三桂麾下听用。
第四，伪清和硕英亲王爱新觉罗阿济格，判剐刑，由投降之建虏图尔格行刑，并准其戴罪立功，前往草原说服蒙古部族来归。
第五，整编宁远的官兵，汰弱留强，淘汰下来的转为民户，分当地屯田为用。
这些屯田中，有相当大部分，是原本已经归于那些投降了建虏的将领名下，比如祖大寿等人。朝廷给于没收，成为整编关宁军的资产。
第六，由关宁军负责，经营觉华岛，以为海军基地之一。
这些旨意，一条条颁布下去，李定国觐见谢恩。
虽然说，因为有袁时中的例子，李定国其实对于自己的封爵，有那么一丝预期。但是，真得封赏下来，他还是非常高兴的。
作为一名武将，封侯拜爵，这是最高的荣誉和追求了。更甚者，他还是造反出身被招安的。
因此，他对崇祯皇帝也就格外地感激，有那种被人重视，士为知己者死的感觉。
崇祯皇帝看着激动的李定国，其实也是有感慨的，不过他倒是还好，只是让李定国平身之后，便对他说道：“卿可知朕安排卿重归于马士英麾下的用意否？”
李定国一听，顿时就一愣。因为他感觉到，崇祯皇帝肯定是另有用意，而不是说像上次一样，再去招募旧部的那种。
果然，崇祯皇帝没等他回答，就对他说道：“流贼现在大部已窜入江西，威胁南京。因此，朕会传旨马士英领兵入南京。不过他最主要的目的，也不是剿贼，而是整顿南京！”
顿了顿之后，他便严肃地继续说道：“南京乃是江南的重心，此次江南整顿地方，最终是否如愿，最为重要的，便是看这南京之行。卿和南京那边的勋贵官员都无瓜葛，又是新封爵位，乃是朕之亲信。有些事情，卿可帮着马士英去做，按律行事，不要有顾虑，懂朕的意思么？”
凤阳府那边的整顿地方，李定国是参与并且感受过的。因此，崇祯皇帝说整顿南京，他大概也知道是怎么回事，便立刻回奏道：“陛下放心，末将只遵皇命！”
他对那些南京的文官武将，还有那么多的勋贵，都不会有好感，想要拉拢他，那是做梦！
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