但只要是，就会，每次醒，两人共同的梦就会变的模，于是两人在梦里相，大学一起读中，之后两人却再也没做过这样的梦。
孔林夕按照约定考上了中，却始终没有找到叫孟小影的同学。….
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某天跟着同学甄思在学校闲，被一段神秘的钢琴乐曲吸，孔林夕随着琴音引，走进一间旧琴，发现弹琴的正是梦里邂逅的孟小影。
两人虽然没有交，但在四目交投之，双方都泛起微妙的感觉。
就这，美丽的爱情故事开始了。
而当孔林夕问及他们第一次见面在百年琴室所听到的神秘乐曲，孟小影却回答：「这是一个不能说的秘密。」
之，二人陷入热恋。
但孔林夕觉得孟小影充满了神，却无法进一步的了解，整个学校所有同学、老师包括自己的系主任父亲都没有人知道她。
某，孔林夕再次约孟小影到琴房见，来的却是甄，甄思的告，孟小影恰好看，之后孔林夕就没有再看到孟小影。
于，孔林夕到处寻找孟小，却始终找不到孟小影。
瞌睡中
醒过来的孔林，就发生了「隔空留言」。
思念小影的孔林夕再次来到第一次见面的老琴，根据回忆谈起《Sre，然后被穿越到了30年，40年，50年后。
穿越几次后孔林夕终于明白「不能说的秘密」的全部真，真相是距离地球3亿光年的某个黑洞发生大爆，引起时空乱，导致有着20年时空差距的孟小影在梦中与的孔林夕交换身，邂，而且还能通过镜像沟，但随着时空乱流恢复正，两人不能再互换身体。
而在2015年的时空，考上中音的孟小影并没有找到孔林，但是在琴房弹奏一本失传的琴谱《Sre》，又再次引发时空乱流被穿越到20年后的同一间教，与被琴声吸引的孔林夕相，相恋。
但这种因时空乱流穿越是有副作用，孟小影最终消失在整个时空，只留在孔林夕的脑海里。
以上就是魔改后的大致剧情。
魔改之后的《不能说的秘密，相比原，影片的前半部分没那么老套。
原片中通过叶湘，路小雨两个名字的首字母yxl和lxy来暗示时空倒，关于路小雨更是给出了四个结，有悲有，有明有暗。
没读北电之，姚东也只看出了路小雨哮喘和叶湘伦穿越到20年前两人在一起的的两个结，也没发现yxl和lx
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