知府衙门经过明代二百多宋的不断重建、添建和修葺直至近年，已经形成一处规模宏大、布局严整的建筑群，全部建筑占地近百亩，厅堂廊舍数百间，庭院数进，布局多路，三条纵轴并列次进，建筑威严，陈设庄重，成为皇宫在基层的缩影。
莱州知府衙门东西宽200米，南北长240米，占地约70亩，总体布局保留了当代的建筑格局和建筑风貌。
特别是位于中轴线上的照壁、大门、仪门、大堂、寅恭门、二堂、内宅门和三堂等主体建筑无不体现官家威严。
府衙大门用黑底锡环，显示着莱州知府作为四品官的等级和地位。大门建筑采用硬山式，三间五架，屋面筒瓦，脊饰吻兽，檐用异型替木。
大门上方高悬莱州府署四个大字，两侧楹联为：“看阶前草绿苔青无非生意，听墙外鹃啼鹊噪恐有冤民”。
东梢间置喊冤鼓，是告状人击鼓鸣冤之处。大门两侧为八字墙。老百姓讲的“八字门，朝南开，有理没钱莫进来”，说的就是这个地方。
大堂称黄堂，又称正堂、正厅、公厅和公堂等。而莱州知府衙门大堂称公廉堂，是知府开读诏旨，接见官吏，举行重要仪式，公开审理案件的地方。
大堂在明间正中设公案，两侧列“肃静”、“回避”牌及青旗、杏黄伞、青扇、铜棍、皮槊等仪仗。大堂公案背景设屏风，上饰云雁。堂前卷棚站的是三班衙役。案犯常羁押在堂前月台下刑皂房待审。知府升堂，师爷随上。
东西梢间辟为夹室，记录堂谕口供。公开审理重大案件时，知府常令仪门大开，让百姓涌到堂前围观。
本来应该是庄严肃穆的知府大堂，现在到处的披麻戴孝，看起来非常的破落和晦气，陈应元他一看到这种场面，他就是生气。
陈应元他问道：“谁允许马某人在这里搞葬礼的？”
推官他就解释说道：“去年的朱万年知府就在这里办理的，都有标准的流程。”
陈应元他愤怒的说道：“你们有什么资格把马某人跟朱大人相提并论，这是本官听到的对朱大人最恶心的侮辱。”
朱万年，字鹤南，云南黎平府人，万历三十七年中举人，历任山东定陶知县，中城兵马司指挥，户部河南司主事，员外郎、郎中，山东莱州知府等。
朱万年平生慷慨，持大节，见国是日非，每酒酣耳熟时对同僚说：“生作奇男子，死为烈丈夫，吾辈不当如是耶！”崇祯五年，叛军孔有德攻莱州，万年率军民固守。叛军久攻
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