本想设立类似于税务总局的衙门，将所有收税差事都管理起来。但他在详细调查后发现，收取田税与人口统计、田地统计等密切相关，强行将收取田税的差事也剥离户部会增加收税的成本，也容易产生问题，所以收取田税的差事只得继续留在户部。
第二，对军事体系再次进行改革：改革军户制。大明的军户制类似于府兵制，但又有所不同，最显著的特点一是府兵居于乡间时并无上官，只有征召为兵时才有将领统辖，而大明的军户时时刻刻有指挥使、千户、百户等武将管着；二是府兵需轮番至京城或边关戍卫，但军户不必。前者导致军户在大明中后期极其受武将压迫，还不如奴隶；后者随着大唐的地盘越来越大导致府兵不愿当兵，大量逃亡或自残。
允熥吸取两者的优点进行改革。其一，军户虽仍是军队编制，归属大都督府管辖，但不再执行对外作战的职能，所有军户男丁只需年满二十岁后在同一省内的其他州府为守备司的兵丁三年，之后除非发生十分重大的事情才能再次征召，如同一般百姓一样；在守备司当差这三年，不必缴纳税赋，而且所有的军户都不必服徭役。自然，原本各卫所的武将也将陆续转到其他职位上。至于守备司，则是允熥新设的一个衙门，在他的构想中类似于后世的武警，由当地知府管辖。
自然，光有武警，没有正规军是不行的。在内地各府、重要地方与边关设立军队，承担防守边疆、镇压造反、出国征战等差事，实行募兵制，招募大明子民为兵。武将则是原本各卫所的武将。当然，主要招募对象仍然是军户。毕竟军户都要在守备司做三年武警，武艺多少要练一些，纪律性也比一般百姓要强，适合当兵。至于‘招募’的方式，则首先以较高的军饷诱惑，其次若招不满，则可半强制征召军户。但仅限于驻地附近的军户，不能强行招募外地的军户。
允熥自己知道这个军事改革方案并不完美，但好歹比之前的制度要强一些，应当不会像卫所知那样很快烂掉。允熥打算利用十年的时间，将这个改革完全推行下去。
其三，则是对文官封爵的改革。所有在四辅官任上退休或病死的大臣，一律加封为子爵；在六部尚书、大学士等官职任上退休或病死的大臣一律加封为男爵；二爵之后无陛下旨意均降等袭爵。允熥要构建勋贵利益共同体，但这个共同体里只有武将世家他不太放心，决定增加文官世家，平衡武将的势力。
允熥在早朝时同时抛出这三项改革，顿时将绝大多数官员打懵了。这三项改革都有人反对，但不论对哪一项改
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