规模进攻，为了“杀鸡给猴看”，他们甚至在当地搞起了种族屠杀。1200名小琉球群岛居民，死于战火和屠杀的有400多人，另有一百多青壮年被荷兰人选拔出来，分批卖到东印度群岛做奴隶。部落的所有女人，则分配给士兵做“礼物”。整个小琉球岛几乎灭族。
此举之酷烈，甚至惊动了荷兰东印度公司总部。巴达维亚东印度公司十七人董事会经过投票发表声名，认定这种做法“不是很妥当”。
当然，所谓“不是很妥当”，也就是随便说说，“不妥当”的事，该做还是做。但是，荷兰人处事也并非一贯酷烈，对一些部落并不赶尽杀绝，而是和他们签订契约，建立统治。其中的目的之一，却是为了方便可以强征他们的人口，再去征服别的部落，既省力气，还能挑动各部落间的仇恨，可谓一举多得。十余年的陆续征服，热兰遮城附近的各主要高山族部落已大部纳入东印度公司的殖民势力当中。
相对生藩土著（高山族人），荷兰人“翻脸”比较快，而对台湾岛上屯垦的明人，荷兰人“翻脸”的速度却比较慢，盖因明人不像生藩原住民那样好欺负，而且距离大明非常近。赤坎，热兰遮两城，也有专门供明人居住的华人区，经济关系一直密切。
按照荷兰驻福尔摩沙殖民者机构统计，正常年份，往返于两岸之间的船只，多达一千多艘，移居到此的明人移民，总数也超过万人。大量沿海明人的到来，对台湾岛的经济结构，带来了深远的影响。早在崇祯六年（1633年）的时候，内地来台的垦荒汉人，就把甘蔗带到了台湾，这个后来成为台湾支柱产业的农作物。
更重要的影响就是牛耕的推广，截止到去年（1638年）的时候，整个台湾岛的耕牛总数已经超过了八百多头，大部分都是垦荒百姓用船从内地运来。以水稻和蔗糖为主，辅以烟草，大麻，生姜，棉花等经济作物。耕地的总田亩数也快速上升，不完全统计，此时台湾的耕地总量，已经超过了二十六万多亩。
可以说，经过数年的发展，荷兰控制下的台湾南部地区，已基本可以实现粮食自给，并能为东印度公司提供大量的甘蔗、鹿皮、药材等原料，开始源源不断地为荷兰人提供殖民利益。
1639年开始，为了应对突发的汉荷战争，巴达维亚总督要求加大解送白银和甘蔗原料。于是，福尔摩沙殖民当局颁布了新的贸易法令，汉人买盐要交税，不得私自收购鹿皮，种植甘蔗也不许私自出售，只能以低价卖给荷兰当局，以便荷兰人制作白糖牟取暴利。
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