粮食也开始短缺。
在奇里乞亚与叙利亚的战役
在黎凡特，皇帝再次主张增强帝国对十字军诸国宗主权并声称他在安条克的权利。1137年他从奇里乞亚亚美尼亚公国手中夺取了塔尔苏斯、阿达纳、摩普绥提亚，奇里乞亚亚美尼亚国王列翁一世与他的大部分家人都成为了俘虏被掠到君士坦丁堡，这为帝国打通了通往安条克公国的路径。
1137年，在约翰二世的压力下，安条克亲王普瓦捷的雷蒙德、埃德萨伯爵乔斯林二世分别向皇帝称臣。甚至的黎波里伯爵雷蒙德二世也急忙向约翰表示臣服，就如同他的前任在1109年向约翰的父亲所做的一样。这些举动使约翰接下来能够领导一直由拜占庭/安条克以及埃德萨组成的联军共同对抗叙利亚的***。尽管阿勒颇因守军太过强大而不能进攻，但巴拉特、Biza'a、Athereb、马拉特努曼以及Kafartab等堡垒都被相继攻取。
尽管约翰为了基督徒的事业在叙利亚战场艰难战斗，他的盟友安条克亲王雷蒙德和埃德萨伯爵乔斯林二世却在约翰二世围攻夏萨期间坐在一起玩骰子袖手旁观。十字军王公们与约翰之间互不信任，并且没人希望别人参加战争来取得利益。雷蒙德也想保住安条克，因为他曾承诺:如果约翰成功夺取了阿勒颇、夏萨、霍姆斯以及哈马，他将把安条克转交给约翰。拉丁和***方面的史料描述了围城中约翰表现出的活力和武勇。这座城市最终被攻陷，但其卫城依然在负隅顽抗。夏萨的埃米尔同意支付一笔巨额赔款，成为了约翰的臣属并支付年贡。约翰此时已经对他的盟友们失去了所有的信心，并且赞吉王朝的军队就要驰援这座城市，因此皇帝只好不情愿地接受了这个条件。
最后的出征
1142年初，约翰为确保(在奇里乞亚的远征军与帝国首都)通过安塔利亚的联系线而对科尼亚的塞尔柱人发动了战役。就在这场战役期间，他的长子共治皇帝阿莱克修斯因热病而去世。在确保了他的路线之后，约翰为了收复安条克着手对叙利亚发动了新的远征。这次远征约翰还计划带着他的军队一起去耶路撒冷朝圣。耶路撒冷国王福尔克，因惧怕皇帝的军事优势将会迫使他的王国向拜占庭称臣并承认其宗主权，乞求皇帝只带适量的护卫前来。福尔克称他贫瘠的王国无法支持如此一支庞大的军队通过。这一温和的请求致使约翰二世决定推迟他的远征。约翰迅速来到北叙利亚，强迫乔斯林交出人质(作为臣服的保证)，其中包括乔斯林的女儿，他之后提出安条克的城
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