人数最多，一方面是他们希望能够远远避开后金军队的骚扰，后金军队想要进攻青海就要通过明国的甘肃、宁夏两地，因此他们想要追击到青海大约是不太可能了。
另一方面则是察哈尔部被右翼部族联军同明军联手击败，明人又继续在经济上封锁察哈尔部据有的归化城的话，察哈尔部不仅没有达到西迁的目的，远离战火，休养生息。还需要同时面对后金、蒙古右翼各部和明人的敌对，这显然比在辽东时更为不利。
反倒是迁往了青海之后，察哈尔部还能通过藏巴汗的关系获得一些物资上的支援。现任的藏巴汗噶玛丹迥旺波，为了抵抗格鲁派同卫特拉蒙古的联盟，已经数次派人同林丹汗进行了接触，试图和他结盟共同反对黄教。
黄教，也就是格鲁派早在万历六年就同土默特俺答汗在西海之畔的仰华寺结成了神圣同盟。俺答汗尊索南嘉措为圣识一切瓦齐尔达喇*喇嘛，而索南嘉措则称俺答汗为忽必烈的化身，以忽必烈的尊号赠俺答汗。
因为有着这层关系，所以漠南蒙古右翼和左翼三万户信奉黄教的部众极多，而四世*云丹嘉措就是俺答汗之曾孙。
林丹汗是布延彻辰汗的长孙，而布延彻辰汗就是被俺答汗所逼迫，被迫迁往辽东的蒙古各部宗主察哈尔部的首领。
也就是说，林丹汗如果承认了黄教，无疑就是等于认同了俺答汗同黄教的神圣同盟，认可了俺答汗是忽必烈的化身，土默特部便享有了同察哈尔部相等的地位，这对于林丹汗来说是不可接受的存在。
因此藏巴汗噶玛丹迥旺波提出的反黄教同盟建议，自然也就迅速打动了林丹汗。但是格鲁派在漠南蒙古中的势力实在是太过强大，即便是此前林丹汗在沙尔呼图克图的劝说，改宗信奉红教，也没能对漠南蒙古各部的黄教信仰造成多少打击，反而使得信奉黄教的蒙古各部对他产生了不满。
林丹汗并不认为这是自己突然改宗的问题，反而觉得这是同俺答汗结好的黄教僧侣对自己的示威行动，因此对于黄教就更为深恶痛绝了。
不过鉴于黄教势力在漠南蒙古各部的盛行，林丹汗也不敢轻举妄动，公开对黄教势力进行打压。他自己是倾向于留在土默特川进行休养生息的主张的，毕竟河套地区乃是漠南蒙古最为中心的根据地，只有掌握了这里才可以真正拥有统一蒙古各部的人力、物力和号召力。
失去了河套地区的蒙古部族，很难让人信服是蒙古各部的宗主。就如同当年把察哈尔部赶去辽东之后，土默特部就成为了事实上的蒙古
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