共举行 11 次。历届年会所讨论议决的提案，多为当时国内教育界重大问题，如有关实业教育、职业教育、修改学制、义务教育、社会教育、推广白话文及拼音字母等。
1921年 10月，广州七届年会制订的《学制系统草案》，一年后由北洋政府略加变动，颁行全国，即“壬戌学制”。1922年八届年会组织“新学制课程标准起草委员会”，历时 8个月，拟订《新学制课程标准纲要》， 直接影响 20年代国内兴起的课程改革。
1922年10月份的教育会议主要讨论的是新学制问题，胡适以北京代表的身份参会，提出调和学制会议原案与广州议案的主张，并作为新学制的主要起草者之一，对新学制的起草完成起到非常重要的作用。
新学制的主要内容包括：将小学七年制改为六年制，中学四年制改为六年制(三三制)，取消大学预科。大学本科仍为四年，学生从大学本科毕业后进研究院。中等教育分为普通教育与职业教育两条路(师范教育包括在职业教育内)。中等教育中的普通教育提倡多设初中，每省只设立一所高中。11月2日，新学制正式公布，除小变动外，全部依据济南大会起草的方案。
胡适在当天的日记中说：“这一次我们把学制案告一结束，总算是一件快意的事。”
胡适一直对作为全国最高学府的北大所取得的学术成就不是很满意。1922年，他致力于北大研究所国学门和北大学术刊物学术著作的设计谋划。
1921年底，北京大学评议会第三次会议公布《国立北京大学研究所组织大纲》，决定改组原有的研究所，作为毕业生继续研究专业学术之所，计划设自然科学、社会科学、国学和外国文学四门(实际只设有国学门)。所长由校长兼任，各门设主任一名，由校长于本校教授中指任。
次年1月，北京大学研究所国学门正式成立。从组织结构看，包括三室五会。“三室”谓登录室、研究室和编辑室，“五会”即歌谣研究会、明清史料整理会、考古学会、风俗调查会和方言研究会。
其中考古学研究室可以说便是今天北京大学考古文博学院的前身。著名金石学家马衡先生为该室第一任主任，该研究室还外聘罗振玉(1865—1940)、法国东方学家伯希和(1878—1945)等著名学者为考古学通信导师，并积极主动寻求与国外考古学术界的合作，影响深远。
马衡先生也因对中国考古学由金石考证向田野发掘过渡有促进之功，被誉
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